De Vlaamse overheid erkent de biologische landbouw als partner in een duurzame toekomst. Het Agentschap Landbouw en Zeevisserij verleent subsidies, erkent de controleorganen en coördineert de reglementering.
Sedert 1 april 2014 is een regeling inzake bedrijfsadvisering in de biologische landbouw in voege gegaan. De regelgeving is gewijzigd sedert 1 april 2019